分子膜堆肥發酵設備采用了無菌系統，避免和防止了空氣中微生物的污染，大大延長了產品的保質期和產品的純，罐體上特別設計安裝了無菌呼吸氣孔或無菌正壓發酵系統。

市政污泥發酵罐堆體溫度的升高是微生物代謝產熱累積的結果，堆體溫度的變化反映了堆體中的微生物活性的變化。